Après une fin de deuxième saison plutôt mouvementée, la saison 3 redémarre plus posément. Walt est prêt à reprendre une vie normale pour tenter de récupérer sa femme et son fils. Ce dernier ne comprends pas ce qui c’est passé et est en colère contre sa mère qui a mis son père à la porte. Jesse sort apaisé de sa cure de désintoxication et jure que la drogue, c’est fini pour lui.
Il semble sincère, la mort de Jane l’ayant beaucoup affecté mais que vaut la parole d’un toxicomane?? Lors d’une explication entre Walt et Skyler, celle finit par lâcher à Walt qu’elle sait qu’il est devenu dealer, mais là ou elle pensait que son mari ne dealait « que » de la marijuana, Walt finit par lui avouer qu’il vend de la méthamphétamine. Furieuse, Skyler exige de Walt qu’il signe les papiers du divorce en échange de son silence.